Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
MKRN3Q13064 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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