Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NFIAQ12857 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms