Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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RABGEF1Q9UJ41 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RABGEF1Q9UJ41 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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