Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
RNF39Q9H2S5 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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RNF39Q9H2S5 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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RNF39Q9H2S5 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
RNF39Q9H2S5 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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