Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 DPH6-202ENST00000440392 3648 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PHLDB2-207ENST00000477695 5813 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LRRTM3-201ENST00000361320 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 WDR44-203ENST00000371825 4029 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TTC6-203ENST00000476979 2253 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF611-206ENST00000595798 2395 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TMEM182-203ENST00000412401 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RBBP8-205ENST00000399725 3260 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SCUBE3-201ENST00000274938 7356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.5 ms