Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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FXNQ16595 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
FXNQ16595 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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