Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC6Q16204 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC6Q16204 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC6Q16204 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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CCDC6Q16204 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CCDC6Q16204 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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