Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ZIC1Q15915 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms