Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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COL9A2Q14055 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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COL9A2Q14055 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
COL9A2Q14055 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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