Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTGDRQ13258 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTGDRQ13258 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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PTGDRQ13258 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTGDRQ13258 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
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