Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFX1Q12986 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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