Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms