Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LRRIQ1Q96JM4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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LRRIQ1Q96JM4 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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LRRIQ1Q96JM4 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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LRRIQ1Q96JM4 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRIQ1Q96JM4 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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