Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SNX29Q8TEQ0 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms