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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC109809.1-201 | ENST00000619665 | 545 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CNOT1-223 | ENST00000628857 | 291 nt | TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SEL1L2-201 | ENST00000284951 | 2224 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ZNF83-201 | ENST00000301096 | 2599 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KTN1-206 | ENST00000413890 | 4473 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | PSG1-205 | ENST00000595124 | 1692 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SAMD9-201 | ENST00000379958 | 6852 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CACNB4-228 | ENST00000636598 | 7808 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | NEB-201 | ENST00000172853 | 20634 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORA72.3-201 | ENST00000365074 | 132 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | DEFB119-202 | ENST00000376315 | 324 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | Y_RNA.408-201 | ENST00000383987 | 102 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL356057.2-201 | ENST00000403318 | 432 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AL024509.3-201 | ENST00000413898 | 745 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | CCDC179-202 | ENST00000532798 | 791 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | ANKRD36C-207 | ENST00000612359 | 650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
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| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC127502.3-201 | ENST00000636170 | 1206 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | AC008505.1-205 | ENST00000637847 | 703 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | TCF12-203 | ENST00000343827 | 3956 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | FAM46D-201 | ENST00000308293 | 3011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SMARCAD1-206 | ENST00000509418 | 2348 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | FTX-214 | ENST00000638437 | 12267 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | KIAA0586-209 | ENST00000556134 | 5912 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | EXOC6-203 | ENST00000371552 | 3564 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SPA17-201 | ENST00000227135 | 853 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | MYOT-201 | ENST00000239926 | 2337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CHCHD4 | Q8N4Q1 | SNORD56.3-201 | ENST00000363507 | 71 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |