Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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CHCHD4Q8N4Q1 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHCHD4Q8N4Q1 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHCHD4Q8N4Q1 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHCHD4Q8N4Q1 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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CHCHD4Q8N4Q1 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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