Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
FOXD1Q16676 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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FOXD1Q16676 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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FOXD1Q16676 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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FOXD1Q16676 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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FOXD1Q16676 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
FOXD1Q16676 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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