Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIK2Q13002 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIK2Q13002 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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