Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PARP3Q9Y6F1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PARP3Q9Y6F1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
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