Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLF2Q9Y5W3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms