Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHAC2Q9Y5I4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHAC2Q9Y5I4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms