Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP1Q9Y3L3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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SH3BP1Q9Y3L3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SH3BP1Q9Y3L3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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