Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNIP3Q9Y2W7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms