Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRAPPC8Q9Y2L5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms