Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
ERVW-1Q9UQF0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ERVW-1Q9UQF0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms