Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CHIC2Q9UKJ5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHIC2Q9UKJ5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms