Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GPN3Q9UHW5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPN3Q9UHW5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms