Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPC1L1Q9UHC9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPC1L1Q9UHC9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms