Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWAP70Q9UH65 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWAP70Q9UH65 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SWAP70Q9UH65 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SWAP70Q9UH65 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SWAP70Q9UH65 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms