Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTSFQ9UBX1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTSFQ9UBX1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms