Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMD4AQ9P2Q2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FRMD4AQ9P2Q2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms