Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IGSF9Q9P2J2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms