Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCDH10Q9P2E7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCDH10Q9P2E7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms