Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFCP2L1Q9NZI6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFCP2L1Q9NZI6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms