Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZDHHC3Q9NYG2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZDHHC3Q9NYG2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms