Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMILIN3Q9NT22 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms