Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTNNBIP1Q9NSA3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms