Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PAPOLBQ9NRJ5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PAPOLBQ9NRJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms