Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE7BQ9NP56 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDE7BQ9NP56 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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