Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUFT1Q9NNX1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUFT1Q9NNX1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms