Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC44

GPBP1L1, Vasculin-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1L1Q9HC44 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPBP1L1Q9HC44 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPBP1L1Q9HC44 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms