Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3GQ9HC16 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOBEC3GQ9HC16 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms