Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF408Q9H9D4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF408Q9H9D4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms