Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NRDE2Q9H7Z3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms