Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC8Q9H0W5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC8Q9H0W5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms