Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CFAP74Q9C0B2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CFAP74Q9C0B2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms