Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFIH1Q9BYX4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms