Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM55Q9BYV6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRIM55Q9BYV6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms