Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRIM54Q9BYV2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms