Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VN1R3Q9BXE9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms