Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYCP2Q9BX26 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYCP2Q9BX26 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms